Valsts mēroga skrīnings Latvijā ievāktu ērču patogēnam Candidatus Neoehrlichia mikurensis .

Abstract

Ik gadu Latvijā ērces inficē vairākus simtus cilvēku, kā arī aizvien izplatītākas kļūst to sugas. Salīdzinoši nesen atklātais Anaplasmataceae dzimtas patogēns Candidatus Neoehrlichia mikurensis, pirmo cilvēka infekciju pēc ērces koduma izraisīja 2014. gadā, turpmāk līdz 2018. gadam izraisot vismaz 18 citus simptomātiskus cilvēka inficēšanās gadījumus. Eiropā šis patogēns ir atrasts vairāk nekā 20 valstīs, taču Latvijā tā prevalence ērču un dzīvnieku paraugos vēl nav pētīta. Literatūras apskats padziļināti aptver Candidatus Neoehrlichia mikurensis identificēšanu, cilvēku inficēšanās gadījumus un to izpausmes, baktērijas morfoloģiju un kultivēšana, kā arī biežākos izplatības vektorus un reģionus. Pētījuma mērķis ir noskaidrot patogēna Candidatus N. mikurensis izplatību un prevalenci ērču paraugos no visas Latvijas, izvirzītā hipotēze - Latvijas teritorijā ievāktie ērču paraugi uzrādīs Candidatus N. mikurensis baktērijas klātbūtni. Pētījumā tika izmantoti no 2017. līdz 2019. gadam ievākti 4596 ērču paraugi, kā analīzes metodi izmantojot groEL gēna amplificēšanu reāllaika PĶR. Iegūtie dati tika apkopoti pa reģioniem, ievākšanas datumiem, sugām, attīstības stadijām, kā arī aprēķināta prevalence un statistiski nozīmības atšķirības grupu starpā. Kopējā inficēto ērču prevalence bija 5,92%, tā liecina par līdzīgām iezīmēm inficēto ērču skaitā ar literatūras daļā aprakstītajiem Eiropas valstu datiem. Veicot statistiskos testus tika noskaidrotas vairākas nozīmīgas sakarības testēto grupu starpā, ieskicējot turpmāko Candidatus N. mikurensis baktērijas pētījumu iespējamos virzienus.

Title: Countrywide screening for tick-borne pathogen Candidatus Neoehrlichia mikurensis in Latvian ticks. Several hundred people are infected by ticks in Latvia every year, and various tick species are becoming increasingly common. In 2014, a tick bite caused the first ever human infection of the recently discovered Anaplasmataceae family pathogen Candidatus Neoehrlichia mikurensis, and at least 18 other cases of people showing similar symptoms have been reported since. The specific tick pathogen has already been identified in more than 20 European countries, yet there are no studies of this bacterium in tick and animal samples in Latvia yet. The literature review of Candidatus Neoehrlichia mikurensis will examine cases of human infection, identification, morphology and cultivation, as well as the most common regions of distribution and vectors. The aim of this study is to understand the distribution and prevalence of the pathogen Candidatus N. mikurensis in tick samples gathered in Latvia. Hypothesis - tick samples collected in the territory of Latvia will show the presence of Candidatus N. mikurensis bacteria. In the study 4596 tick samples were collected from 2017 to 2019 and analyzed by using real-time PCR for groEL gene amplification. The obtained data was ordered by regions, dates of sample collection, species and developmental stages. The prevalence of the infected ticks was calculated and the statistically significant differences between groups was determined. The overall prevalence of infected ticks was 5.92%, therefore indicating that the proportion of infected ticks is similar when compared to data from other European countries described in the literature. Several important correlations between the tested groups were found, outlining the possible further directions of studies involving Candidatus N. mikurensis bacteria.